MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum ATCC 824 chromosome

Total Repeats: 85101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003030	A	6	6	495	500	100 %	0 %	0 %	0 %	15893299
2	NC_003030	ATA	2	6	509	514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893299
3	NC_003030	TAA	3	9	651	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893299
4	NC_003030	ATA	2	6	671	676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893299
5	NC_003030	ACT	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893299
6	NC_003030	A	6	6	683	688	100 %	0 %	0 %	0 %	15893299
7	NC_003030	GAA	2	6	716	721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893299
8	NC_003030	ACAA	2	8	755	762	75 %	0 %	0 %	25 %	15893299
9	NC_003030	TTC	2	6	781	786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893299
10	NC_003030	GTAATA	2	12	828	839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15893299
11	NC_003030	TGC	2	6	850	855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15893299
12	NC_003030	TTGCTG	2	12	861	872	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15893299
13	NC_003030	ATT	2	6	898	903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893299
14	NC_003030	TA	3	6	904	909	50 %	50 %	0 %	0 %	15893299
15	NC_003030	GGA	2	6	911	916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15893299
16	NC_003030	ATA	2	6	969	974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893299
17	NC_003030	TCT	2	6	1001	1006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893299
18	NC_003030	GAC	2	6	1043	1048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893299
19	NC_003030	TGA	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893299
20	NC_003030	GTTCA	2	10	1106	1115	20 %	40 %	20 %	20 %	15893299
21	NC_003030	AAG	2	6	1137	1142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893299
22	NC_003030	T	6	6	1145	1150	0 %	100 %	0 %	0 %	15893299
23	NC_003030	AACA	2	8	1178	1185	75 %	0 %	0 %	25 %	15893299
24	NC_003030	ACC	2	6	1207	1212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15893299
25	NC_003030	GGA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15893299
26	NC_003030	A	6	6	1319	1324	100 %	0 %	0 %	0 %	15893299
27	NC_003030	AG	3	6	1397	1402	50 %	0 %	50 %	0 %	15893299
28	NC_003030	TTTAA	2	10	1559	1568	40 %	60 %	0 %	0 %	15893299
29	NC_003030	A	6	6	1600	1605	100 %	0 %	0 %	0 %	15893299
30	NC_003030	AACT	2	8	1647	1654	50 %	25 %	0 %	25 %	15893299
31	NC_003030	GGA	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15893299
32	NC_003030	A	6	6	1725	1730	100 %	0 %	0 %	0 %	15893299
33	NC_003030	TCT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893299
34	NC_003030	AGA	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893299
35	NC_003030	TGA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893299
36	NC_003030	TC	3	6	1794	1799	0 %	50 %	0 %	50 %	15893299
37	NC_003030	ATA	2	6	1804	1809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893299
38	NC_003030	A	7	7	2080	2086	100 %	0 %	0 %	0 %	15893300
39	NC_003030	AAG	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
40	NC_003030	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893300
41	NC_003030	CAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15893300
42	NC_003030	AAAT	2	8	2230	2237	75 %	25 %	0 %	0 %	15893300
43	NC_003030	AGA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
44	NC_003030	GTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893300
45	NC_003030	AAT	2	6	2291	2296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893300
46	NC_003030	AAT	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893300
47	NC_003030	TAA	2	6	2363	2368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893300
48	NC_003030	A	6	6	2455	2460	100 %	0 %	0 %	0 %	15893300
49	NC_003030	AAATT	2	10	2556	2565	60 %	40 %	0 %	0 %	15893300
50	NC_003030	AAG	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
51	NC_003030	TTA	2	6	2665	2670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893300
52	NC_003030	GAT	2	6	2682	2687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893300
53	NC_003030	AT	3	6	2719	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	15893300
54	NC_003030	ATA	2	6	2748	2753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893300
55	NC_003030	ACT	2	6	2759	2764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893300
56	NC_003030	AAT	2	6	2792	2797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893300
57	NC_003030	GAA	2	6	2802	2807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
58	NC_003030	AGA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
59	NC_003030	AG	4	8	2855	2862	50 %	0 %	50 %	0 %	15893300
60	NC_003030	GAT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893300
61	NC_003030	AGA	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
62	NC_003030	AATA	2	8	2969	2976	75 %	25 %	0 %	0 %	15893300
63	NC_003030	GAA	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893300
64	NC_003030	ATT	2	6	3096	3101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893300
65	NC_003030	ATG	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893300
66	NC_003030	AAGT	2	8	3202	3209	50 %	25 %	25 %	0 %	15893301
67	NC_003030	TA	3	6	3288	3293	50 %	50 %	0 %	0 %	15893301
68	NC_003030	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893301
69	NC_003030	AT	3	6	3348	3353	50 %	50 %	0 %	0 %	15893301
70	NC_003030	TTA	2	6	3442	3447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893302
71	NC_003030	TA	3	6	3450	3455	50 %	50 %	0 %	0 %	15893302
72	NC_003030	A	6	6	3455	3460	100 %	0 %	0 %	0 %	15893302
73	NC_003030	ATA	2	6	3490	3495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
74	NC_003030	TAA	2	6	3509	3514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
75	NC_003030	A	6	6	3513	3518	100 %	0 %	0 %	0 %	15893302
76	NC_003030	AAT	2	6	3537	3542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
77	NC_003030	ATAAGG	2	12	3610	3621	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15893302
78	NC_003030	TTA	2	6	3625	3630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893302
79	NC_003030	A	7	7	3687	3693	100 %	0 %	0 %	0 %	15893302
80	NC_003030	A	6	6	3720	3725	100 %	0 %	0 %	0 %	15893302
81	NC_003030	ATAAAT	2	12	3729	3740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
82	NC_003030	A	6	6	3752	3757	100 %	0 %	0 %	0 %	15893302
83	NC_003030	GTT	2	6	3767	3772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893302
84	NC_003030	AGA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893302
85	NC_003030	ATT	2	6	3886	3891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893302
86	NC_003030	ATA	2	6	3907	3912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
87	NC_003030	A	6	6	3948	3953	100 %	0 %	0 %	0 %	15893302
88	NC_003030	ATGAT	2	10	3964	3973	40 %	40 %	20 %	0 %	15893302
89	NC_003030	ATG	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893302
90	NC_003030	AGC	2	6	3988	3993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893302
91	NC_003030	ATTC	2	8	4068	4075	25 %	50 %	0 %	25 %	15893302
92	NC_003030	AGA	2	6	4148	4153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893302
93	NC_003030	ATT	2	6	4154	4159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893302
94	NC_003030	TTTA	2	8	4163	4170	25 %	75 %	0 %	0 %	15893302
95	NC_003030	AAAT	2	8	4243	4250	75 %	25 %	0 %	0 %	15893302
96	NC_003030	TGA	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893302
97	NC_003030	AT	4	8	4409	4416	50 %	50 %	0 %	0 %	15893302
98	NC_003030	TAA	2	6	4444	4449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893302
99	NC_003030	A	6	6	4484	4489	100 %	0 %	0 %	0 %	15893302
100	NC_003030	AGG	2	6	4546	4551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15893303
101	NC_003030	GTT	2	6	4585	4590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893303
102	NC_003030	AGA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893303
103	NC_003030	GGAT	2	8	4677	4684	25 %	25 %	50 %	0 %	15893303
104	NC_003030	TTG	2	6	4685	4690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893303
105	NC_003030	GTT	2	6	4801	4806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893303
106	NC_003030	A	7	7	4851	4857	100 %	0 %	0 %	0 %	15893304
107	NC_003030	ATG	2	6	4866	4871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893304
108	NC_003030	ATA	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893304
109	NC_003030	GAT	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893304
110	NC_003030	TAA	2	6	5127	5132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893304
111	NC_003030	AGG	2	6	5185	5190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15893304
112	NC_003030	TGT	2	6	5212	5217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893304
113	NC_003030	GAAGTA	2	12	5240	5251	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15893304
114	NC_003030	AT	3	6	5265	5270	50 %	50 %	0 %	0 %	15893304
115	NC_003030	AAAC	2	8	5273	5280	75 %	0 %	0 %	25 %	15893304
116	NC_003030	A	6	6	5313	5318	100 %	0 %	0 %	0 %	15893304
117	NC_003030	TGA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893304
118	NC_003030	AT	3	6	5348	5353	50 %	50 %	0 %	0 %	15893304
119	NC_003030	TATGAT	2	12	5390	5401	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15893304
120	NC_003030	GA	3	6	5419	5424	50 %	0 %	50 %	0 %	15893304
121	NC_003030	TGA	2	6	5464	5469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893304
122	NC_003030	ATT	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893304
123	NC_003030	ATG	2	6	5625	5630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893304
124	NC_003030	AT	3	6	5643	5648	50 %	50 %	0 %	0 %	15893304
125	NC_003030	TAA	2	6	5659	5664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893304
126	NC_003030	AC	3	6	5668	5673	50 %	0 %	0 %	50 %	15893304
127	NC_003030	CAG	2	6	5808	5813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15893304
128	NC_003030	ACAA	2	8	5851	5858	75 %	0 %	0 %	25 %	15893304
129	NC_003030	TTG	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15893304
130	NC_003030	ATA	2	6	5903	5908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893304
131	NC_003030	GAA	2	6	5933	5938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893304
132	NC_003030	TAG	2	6	5976	5981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15893304
133	NC_003030	GCT	2	6	5999	6004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15893304
134	NC_003030	AGA	2	6	6026	6031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893304
135	NC_003030	TCA	2	6	6080	6085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15893304
136	NC_003030	AT	4	8	6107	6114	50 %	50 %	0 %	0 %	15893304
137	NC_003030	GAA	2	6	6153	6158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15893304
138	NC_003030	AAT	2	6	6196	6201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15893304
139	NC_003030	TGG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15893304
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